Hlavnou funkciou penetračného náteru nie je len ochrana stien pred vlhkom, ale aj ich dôkladná príprava na nanášanie ďalších vrstiev náteru, teda farieb. Penetračný náter spevní podklad a zjednotí jeho nasiakavosť. Nestane sa potom, že sa farba v jednom mieste uchytí dobre a na inom nie. Penetrácia tiež zvyšuje priľnavosť povrchu.
Penetračný náter slúži predovšetkým ako príprava podkladu pre ďalší náter. Penetrácia a penetračné hmoty sú vhodné ako pre nové podlahy, tak aj pre ostatné materiály, z ktorých bol zoškrabaný či inak odstránený pôvodný náter.
Penetrovanie podlahy sa vykonáva rovnomerne, priamym penetračným náterom pomocou štetca alebo valčeka. Penetrácia by mala minimalizovať nasiakavosť podkladu zabezpečiť vysokú priľnavosť.
